Résumé

Le transfert horizontal de gènes (HGT), c'est-à-dire l'acquisition de matériel génétique indépendant de la reproduction cellulaire, est un facteur important de l'évolution bactérienne; il contribue à la fois à la stabilité génomique et à l'acquisition de nouveaux traits phénotypiques. Les bactériophages et les «Agents de Transfert Génétique» (GTAs) sont reconnus comme d'importants vecteurs de HGT, sans doute les plus significatifs dans certains environnements et groupes phylogénétiques. Les GTA sont des bactériophages lysogènes incapables de répliquer leur propre ADN; ils ont été domestiqués par des bactéries-hôtes pour empaqueter des fragments de leur ADN et les transférer à des souches apparentées. Au sein de certains lignages de bactéries, les GTAs ont été transmis verticalement sur des centaines de millions d'années, ce qui suggère qu'ils confèrent un avantage significatif aux bactéries qui les produisent. La contribution des GTAs à l'adaptation écologique et à l'évolution des bactéries est loin d'être entièrement comprise. Dans le cadre de ce projet, nous utilisons des techniques de biologie moléculaire, d'évolution expérimentale et de bioinformatique pour élucider la contribution  des bactériophages et des GTAs au transfert génétique horizontal chez les protéobactéries; dans une perspective plus évolutive, nous utilisons des expériences de compétition et d'évolution expérimentale dans le but d'identifier les conditions qui influencent l'évolution et la maintenance des GTAs et autres particules viroïdes dans des bactéries modèles.